셋 다 일단 통계분석이긴 한데... 거기까진 감이 좀 오시죠? 근데 저게 다 뭐시여...? - PCA(Principal Component Analysis): 주성분분석- MCA(Multiple Correspondence Analysis): 다중 대응분석- FAMD(Factor Analysis of Mixed Data): 혼합 자료의 요인분석 (feat. 안티그래비티 번역)이렇다.일단 ADsP(혹은 빅분기나 ADP) 준비하셨던 분들 PCA 뭔지 들어보셨죠? 그죠. 그 차원 축소하는 그거. 나머지 둘은 PCA 칭구칭긔들… 그니까 똑같이 차원 축소 하는 애들이다. 아니 하나만 해도 골치아픈데 저런게 왜 세개나 있는데요? 그건 분석 들어가면서 설명드림.import numpy as npimport pandas a..
그 열역학 엔트로피를 아십니까? '평형 상태로의 이동 정도' 또는 '유효하게 이용할 수 있는 에너지의 감소 정도'나 '무효 에너지의 증가 정도'를 의미하며, 제 2 법칙에 의하면 항상 증가만 하는 그거 말이다. 섀넌 엔트로피도 그건데, 이제 그거는 '정보를 내보내는 근원의 불확실도를 나타내는 양' 또는 '정보량의 기대치'를 의미한다. 음… 쉽게 얘기하자면 엔트로피가 무질서도잖아요? 정보량의 무질서도 뭐 그런거라고 생각하시면 된다. 나도 뭔지 잘 모름. 스읍… 이게 정보 관련된거긴 한데 나도 잘 모르것다… 일단 내 이해한데까지는 설명해보겠음. 아무튼 저게 뭔지를 설명하기 전에 정보량이 뭔지를 먼저 이해해야 한다. 내일 해가 동쪽에서 뜨는거랑, 내일 출근길에 무심코 샀던 로또가 주말에 1등 되는거랑 어느쪽이..
오늘은 좀 다채롭습니다. 왜냐고? 뭐가 많이 들어서.그 우리 이제 할만큼 하셨으니까... 전처리는 다 안올릴게여... 내가 귀찮아서 이러는거 맞음. 내가 네이버 티스토리 미디움에 동시에 올리는데 그러면 복붙을 몇 번 하는겁니까...배경설명이번에 가져온 데이터베이스의 주제가 Kinase Inhibitor입니다. 이게 뭔데요? 를 설명하려면 kinase와 inhibitor를 다 설명해야 하는데… 아… Kinase는 뭐에 인산기를 붙이는 효소입니다. 인산기는 PO4(3-)고, 그걸 어디다가 붙이는 놈들이 다 카이네이스예요. 인산기를 어디다가 붙이는가는 효바효(효소 바이 효소)지만 어쨌든 인산기를 갖다 붙입니다. 보통 ATP에서 떼다가 붙이긴 합니다만. 자, 그럼 인히비터에 대한 얘기를 해봅시다. 우리 몸의 모..
얘는 스케일이 좀 다운됐음... 왜냐고요? 게놈이 7500bp거든요. 이걸 인플루엔자나 한타때처럼 2~300개 돌린다? 켜놓고 자고 일어나야됩니다. 아니 리눅스로 하셨어요? 걔로 하면 중간에 뻗음. 맥북으로 돌린건데도 이정돕니다.쟤는 또 뭐 하는 애임?여러분 감기랑 독감이랑 다릅니다. 단순히 증상이 다른게 아니라 원인 병원체가 달라요. 독감은 인플루엔자가 원인이고 감기는 라이노바이러스라는 놈이 원인이거든요? 다른 바이러스도 있다만. 그거 아십니까? 감기에는 약이 없음. 아니 저희 병원가면 약 주는데요? 그건 '증상을 완화시키는' 약이지 감기 바이러스를 조지는 약이 아닙니다. 아니 그럼 감기약이라고 하면 안되는거 아닌가요? 진정하십쇼. 감기 바이러스는 스포닝풀에서 저글링 뽑아내는것처럼 캐많아요. 그걸 일일..
결론부터 말하자면 분석은 된다. 되는데 데이터 리소스를 NCBI로 하는 건 비추다. 왜냐고? 그 이유는 올리면서 말해드림..def plot_lht_family_tree(alignment_file): align = AlignIO.read(alignment_file, "fasta") calculator = DistanceCalculator('identity') constructor = DistanceTreeConstructor(calculator, 'nj') tree = constructor.build_tree(align) fig = plt.figure(figsize=(15, 8)) ax = fig.add_subplot(1, 1, 1) plt.title("Arab..
https://seaborn.pydata.org/tutorial/color_palettes.html Choosing color palettes — seaborn 0.13.2 documentationChoosing color palettes Seaborn makes it easy to use colors that are well-suited to the characteristics of your data and your visualization goals. This chapter discusses both the general principles that should guide your choices and the tools in seaborn thseaborn.pydata.org여기 들어가보면 아주 온갖..
별건 없고 걍 통계분석 관련해서 서술하려고 만들었음... 네이버는 수학 카테고리가 따로 있고 미디움은 주제를 통계학으로 하면 되는데 얘는 아니거덩요. 이론 비중이 좀 높은건 앞으로 거기다 쓰겠습니다. 전용 태그도 있음.
쓰던 컵이 이가 나가서 고르고 고르다가… 이과생의 로망 예? 비커에 커피마시기가 생각나서 비커컵을 샀음. 실험실에서 정말 지겹게 봤던 그거 맞습니다. 예. 엄마가 보자마자 눈으로 욕하시더군요… 근데 나 물건을 받았는데 구매확정이 안됨…
일단 그… 뭔가 통계적으로 뭔가 있어야 하지 않나 싶어서 추가는 했습니다. 근데 아… 포폴에 쓸거 늘었어… 그거 하는김에 아예 그래프 칼라도 수정했습니다. 씨본 컬러맵이 이쁜게 많은건 맞는데, 그 컬러맵도 적재적소에 써야 해요.맨-휘트니 u 검정그… t-test라고 아시죠? 스튜던츠 t-test. 그게 단일집단이건 두개건 비포애프터건 비교할 때 쓰는 건 맞는데… 어? 그럼 티테스트 쓰면 되잖아요. 그죠 써도 되는데… t-test에는 조건이 있어요. 일단 샘플 수가 30개가 안되면 샘플 크기에 따라서는 정규성/등분산성을 확인하고 진행해야 하고, 너무 적으면(10개보다 적으면) 비모수검정으로 빠져야됩니다. 그 일단 스튜던츠씨는 t가 대문자인지 소문자인지 딱 정해주고 다시 가시면 되겠고… 그럼 그 정규성이랑 ..
https://koreanraichu.tistory.com/760 포켓몬 이로치가 나올 확률로 이항분포를 때려보자일단 이항분포가 뭐냐… 특정 확률(p)을 가진 베르누이 시행을 n번 독립적으로 반복했을 때, 성공하는 횟수(X)에 대한 이산 확률 분포라고 한다. Pass or Fail 뭐 이런건데, 여기서 중요한 건 결과가koreanraichu.tistory.com이거 파이썬으로 하는거 맞음.성비와 이항분포포켓몬에는 성비가 존재한다. 성비가 불명(무성)이거나 한쪽으로 쏠려있는 경우도 있지만 보통은 암수가 다 있는데 비율이 다른 경우가 많다. 님들 솔직히 세꿀버리 비퀸 만들어야되는데 암컷 안떠서 피눈물 흘리신 적 있으시죠? 난 있음... 아오 포고 야도뇽이 자꾸 수컷만 나와서 대환장파티여... # p(성비):..
1. 완전히 제출까지 끝났다. 홀가분하다. 2. 지금까지 했던 EDA가 다들 하나같이 목적이 없이 걍 이것저것 해보다가 방향이 생기면 하는 방식이었어서 초반에는 그것때문에 혼자 산으로 가고 그랬다. 혼자 개트롤하는거 아닌가 스트레스 심했음… 3. 감각을 키우려면 그냥 많이 해봐야 한다… 그게 답이다. 4. 우리팀은 ㄹㅇ 공대장 만나서 포폴용으로 써도 될 퀄의 PPT가 나왔음. 너무 갓팀이셨다… 5. 일요일에 노래방이나 가야지. 6. 인생이 그렇게 재미있지는 않은데, 간만에 이벤트 했다 생각해야지. 덕분에 좋은 사람들도 만났고. 7. 포폴 만들어야되는데 템플릿 찾아놔야지… 가장 귀찮은 일이 이거임.
https://koreanraichu.tistory.com/839 캐글 EDA-마! 서퍼티파이!https://www.kaggle.com/datasets/serkantysz/550k-spotify-songs-audio-lyrics-and-genres/data 550K Spotify Songs: Audio, Lyrics & GenresEnhanced Music Dataset with Audio Features, Lyrics, Genres & Artist Metadatawww.kaggle.com참고로 본인은 스포티파koreanraichu.tistory.com우리 어제 전처리까지 하고 끝냈음… 기억하시죠? 하다하다 VScode가 뻗었다고…아티스트 분석여기는 뭐 없어서 분량도 짧다. # 1그룹에 다 몰렸구나.....