그 전에 clinVar 하면서 태블로 대시보드 만들었죠? 거기서 염색체별로 Top 25 만들고 그랬는데… 그거를 이제 CLNVC(변이)별로 뭐가 제일 많은지 보자는 얘기다. SNV는 저번 글에 나와있었기 때문에 생략.들어가기 전에-이게 뭔 변이임?이 블로그에 들어오시는 분들중에는 생물정보학을 하고 있거나, 나처럼 업으로 삼지는 않았지만 거기에 관심이 있거나, 생물학 전공인 경우도 있겠지만 어때요? 여기 들어와서 clinVar라는 걸 처음 보신 분도 계시지 않습니까? 그래요, 그겁니다. EDA 따라오면서도 이게 뭐여 해서 뭔가 찾아보니 보이는 것은 꼬부랑글씨였으며… 물론 유전자에 문제가 생긴다고 다 질병이 되는 건 아니고, 피부 색이나 눈 색, 머리카락 색같이 사람의 형질이 달라지는 경우도 있긴 있습니다...
지난 이야기: 아 염색체별로 CLNSIG 비중이 이렇구나Pathogenic 일로와봐 pathogenic_df = clinvar_df.filter(pl.col('CLNSIG_Group') == 'Pathogenic')이렇게 하면 됩니다.CLNVC별로 보기clnvc_grp = clinvar_df.group_by('CLNVC').agg( pl.col('CLNSIG').count().alias("Total")).sort('Total', descending=True)묶어드렸습니다^^ fig = go.Figure()fig.add_trace( go.Bar(x = clnvc_grp['CLNVC'], y = clnvc_grp['Total'], marker_color = px.colors.sequential...
오늘 블랙데이라 짜장면 사러 갔는데 지에스에 있어서 사봤음. 1. 짜파게티나 풀무원 대파짜장... 백짜장도 먹어봤는데 얘는 짜장'라면'이아니라 중국집 짜장면 맛이 남. 2. 건더기스프는 따로 없고 풍미유랑 짜장소스만 들어있음. 건더기는 짜장소스 안에 따로 있는데요... 근데... 건더기좀 더 줘라... 이게 뭐냐... 3. 이거 5개들이 묶음으로 나왔으면 하나 사왔을 것 같음.
전에 깔짝깔짝 판다스랑 비교했던 폴라스로… EDA가 될지 해봤다. 그래서 전에 했던거랑 내용은 같은데, 비교하는 툴이 달라지는겁니다. 이거 아마 포폴에도 폴라스 플롯틀리로 올라갈듯함. 근데 새로 나온건 알겠어, 이걸 써봐야 해? 네카라쿠배의 배에서 쓴답니다. 전처리는 이전 과정이랑 비슷하니까 그룹바이랑 필터 위주로 ㄱㄱ합시다.clinvar_df = pl.read_csv('data/clinvar_20260404.csv', infer_schema_length=0)얘는 판다스에서 붙는 메모리 관련 옵션이 아예 안 붙는다. 근데 뭔가 붙어있지 않냐고? 걍 열면 Original error: invalid primitive value found during CSV parsing 에러 뜨니까 걍 다 읽고 판별하셈 한..
일단 뛰고 생각해보죠. 1000개는 주말임다.
오늘은 전체샷 없고 개별샷만 있음1. 안경 다리 실리콘이게 보통 언제 바꾸냐면 쟤가 미끼덕거리면 바꾸거든요? 근데 생각보다 주기가 짧아… 그래서 생각보다 자주삽니다… 2. 이어폰 파우치본인 스위치용 이어폰이 따로 있음. 그거 보관하려고 산건데 크기는 음… 얼마전에 산 이브이 키캡키링은 들어갈 정도? 생각보다 좀 작음. 그리고 이거 한손으로 입구 열기가 좀 힘듭디다… 3대 500까지는 안 쳐도 되는데 힘 좀 줘야 열림. 3. 피젯토이저렇게 말려있는걸 돌돌돌 풀면서 놀면 되는 대단히 심플한 장난감인데 좀 뻑뻑함. 갖고 놀면서 길들여놔야겠음. 이거 풀면 어떻게 되냐고요? 요래됨. 4. 노트그냥 노트다. 나중에 취업하면 업무일지 하려고 산건데… 그래요 일단 취업을 해야겠지만… 아무튼. 아빠가 탐내고있음…
보통 판다스 데이터프레임 불러와서 지지고 볶고 뭐 해요? 그래프 그리죠. 표로 정리해서 보여주는것보다 그래프 딱 만들어서 도표 딱 보여주면 기깔나쟎아요? 그겁니다. 그리고 우리가 제일 많이 쓰는 맷플롭이나 씨본(+Plotly)에서도 폴라스를 받아줄지 궁금해서 해봤습니다. 이번에 써 볼 데이터프레임은 파일 불러온거 하나(켐플) 있고, 직접 만든거 하나 있습니다.import polars as plimport matplotlib.pyplot as pltimport seaborn as snsimport plotly.express as px # 프로젝트 이런거 아니니까 걍 얘 부를게여위에서부터 순서대로 폴라스, Matplotlib, 씨본, Plotly임다. 불러오십쇼. pyarrow는 불러올 필요 없고 설치만 하..
에드워드리의 얼굴과 함께 부추전스낵이 보인다. 봉지가 수상하게 빵빵해보이지만 상한건 아니다. 아니어야됨. 한봉지 다 비웠단말이야… 과자봉지 안에 뭐가 들어있어서 꺼내봤더니 소스였다.유얼 까까 이즈 히얼 1. 김치전스낵 대비 기름진 느낌은 없었음. 맛은 부추전인데 부추가 좀 넉넉하게 들어간 부추전맛… 봉지 까자마자 부추전 향이 올라옴. 2. 저 디핑소스는 전 찍어먹는 간장맛인데 미묘하게 점도가 추가된 느낌임. 물엿이나 올리고당을 넣었나…?3. 스낵이 얇고 디핑 찍어먹으면 맛있긴 한데… 디핑 없어도 먹을만은 해요… 4. 해물파전 스낵도 만들어주셈!
엥? 폴라스? 그게 뭐예요오? Polars is an open-source library for data manipulation, known for being one of the fastest data processing solutions on a single machine. It features a well-structured, typed API that is both expressive and easy to use. 뭐라는겨 싶겠지만 폴라스는 판다스 비슷한 일을 한다. 데이터프레임을 만들거나 불러오거나 하는 모든 일들이 가능한데 일단 읽는 속도가 판다스보다 20배 빨랐음. 뭐 메모리 어쩌고 하던데 나는 컴퓨터 아키텍쳐까지는 잘 모르니까 패스하고... 판다스랑 좀 다른 부분이 있다는 건 유념하십쇼.im..
하지만 만드는 건 팀플 끝나고 해야됨… 이거 만들려면 방 하나를 통으로 써야 합니다.
끝나기는 15일에 끝나는데 어차피 팀플이라 후기 지금 씁니다. 그리고 미리 말하는데 본인 원래 장단점 가감없이 쓰는 스타일임. 물론 돌려말하거나 할 수는 있지만.1. 당신이 파이썬을 몰라도 상관 없다. 개뉴비여도 배울 의지만 있다면 추천한다. 이건 파이썬 n회차들이 갑갑해할 정도로 상세하게 나간다. 본인은 고인물까지는 아니지만 파이썬 n회차라 초반에 좀 답답한 부분이 있었음. 2. 팀플이 세 번 있고 팀을 우리가 짜는 게 아니라 저쪽에서 짜준다. 그리고 애초에 대면교육이 아니기때문에 친밀도 이벤트따위 없음. 그래서 나 아직도 우리 회고팀 얼굴 모름. 3. 팀플이… 음… 일단 내가 만났던 분들은 다 좋은 분들이긴 했음. 근데 그거랑 별개로 팀플 진행하면서 세부적인 스타일은 좀 안 맞을 수 있음. 4. 팀플..
https://www.boannews.com/media/view.asp?idx=142897&skind=6 [단독] “설치형 보안 SW 다 빼!”... 정부 지시에 여의도 금융권 ‘패닉’범부처 차원의 정보보호 종합대책의 일환으로 금융권 설치형 보안 소프트웨어 강제 폐지가 급물살을 타며 대격변이 예고됐다. 정부는 글로벌 스탠더드에 맞춘 근본적 체질 개선을 강력히 요구www.boannews.com내가 시중 은행 관해서 얼탱이없는게 두가지 있는데 하나는 인터넷뱅킹 잠금 관련이고 다른 하나가 저거임. 왜 여러분들 은행에 볼일 보러 갈때 veraport나 엔프로텍트같은 거 깔라고 하죠? 그걸 다 빼라는겁니다. 우리 입장에서는 좋은게 일단 털리는거고 나바리고 니네한테 책임 안 묻고 안 깐다고! 해도 쟤네가 억지로 ..