Biopython-Q&A

Q&A지만 자문자답이다. 어쨌든 질답은 맞음 

---

Q1. MSA의 그 clustalW랑 MUSCLE은 어찌됐나요? 

A1. 그거 둘다 깔아야 됩니다. OS 박고 경로 박아서 돌리는 거 나오긴 했는데 트라이 해보려고 했더니 윈도 기준이네... 머슬은 경로 박아서 해봤는데 커맨드만 나와서 MSA는 터미널로 돌리고 있습니다. 리눅스는 clustalw와 MUSCLE 둘 다 일단 설치해두면 터미널에서 돌릴 수 있습니다. (py파일로 아웃풋 설정도 가능)

 

Q2. 일부 건너뛴 챕터들이 있던데...? 

A2. 실습용 자료 구하기가 빡세거나(얘네도 다 안올려줌...) MSA처럼 할 수 없는 여건인 경우 건너뜁니다. 그래서 16 17(이건 하려고 했는데 wordcloud 하느라 시간 다 잡아먹음) 건너뛰고 케그 했지... 

 

Q3. 하면서 제일 재미없었을 때+제일 재밌었을 때는? 

A3. 실습할 거리가 많으면 많을수록 꿀잼입니다. clustering은 실습할 거리도 없는데다가 초장에 이론 나와서 노잼... 

 

Q4. 쿡북 보면서 할 때 제일 빡쳤던 부분은? 

A4. 처음에는 설명도 막 디테일하게 하고 이거이거이거 다돼! 이러더니 뒤로 갈수록 코드에 오타나고 모듈 빼먹고... 예제대로 따라하면 에러가 반기는... 심지어 그 에러 내가 찾아서 다 수정했어...... 쓰다가 귀찮았는지는 모르겠는데 귀차니즘이 거기서 터지면 안되지 이놈들아... 

 

Q5. 전체적인 개발 환경은? 

A5. 이건 따로 글 올려드리겠음. 여기다 풀면 분량이 길어져서;; 

 

Q6. 가끔 보다보면 응용편이 있던데 그건 대체 어떻게 떠올리신거죠 

A6. 화장실에서 X싸다가요. 이게 측간신 버프인가 그건가 그냥 코드 보면 떠오를 때도 있습니다. for문으로 돌리는거 while로 돌려본다던가... 

 

Q7. 저도 할수 있을까요? 

A7. 저도 파이썬 잘 못하는데 하잖음. 

 

Q8. IDE 배경색 뭐쓰세요?

A8. 원래 밝은 색 썼었는데 지금은 걍 깜장배경 씁니다. 개발자들은 깜장배경이 국룰인가... Jupyter는 흰 바탕입니다. 

 

Q9. 코드블럭에 입력하는 거 귀찮지 않으세요? 

A9. 노션은 코드블럭이나 있으니까 그나마 복붙하면 장땡이지 미디움은 코드블럭도 없어서 스크린샷 찍어서 붙입니다. 네이버도 초창기에 코드블럭 찾기 전에 쓴 건 스크린샷이었는데... 근데 결과 길면 복붙도 귀찮음 진짜... 

 

Q10. 코딩은 어디서 하세요?

A10. 방해받기 싫어서 스터디카페 가서 합니다. 군자역 열공다방 짱짱맨. 근데 밥 먹을데가 없음... 그리고 집중하다보면 끼니도 잊어버려서 음료수로 배 채우다가 집 가서 밥 먹습니다... 그래서 아침먹고 저녁먹고 야식먹고 근데 왜 살이 빠졌지...

 

Q11. 코딩할 때 중요한건 뭐라고 생각하십니까?

A11. 막 한번에 완성하려는 생각은 버리시고, 코드 입력하기 전에 대충 어떻게 돌아가면 좋을지 한번 그려보세요. 기능 구현하는 방법은 모르면 찾으면 되지만 그것도 무슨 기능을 어떤 식으로 구현할 지 알아야 찾아요. 아, 한가지 더. 큰 그림을 그릴 때는 일단 차근차근 해봅시다. 작은 단위(의 고정된 수치)로 먼저 해보고 점차 규모를 키워나가던가 일반화해야지 첫빠따에 일반화하려고 하면 에러가 여러분을 반깁니다. 내가 그래서 에러랑 많이 만났음 

 

Q12. 개발자한테 한마디?

A12. 문의메일 왜 안받냐. 심지어 내가 썬더버드로 보내서 메일 지메일인데. (리눅스 썬더버드에 지메일 연결함) 

 

Q13. 운영체제는 꼭 리눅스여야 하나요? 

A13. 윈도 편하면 그거 쓰세요. 리눅스는 tkinter인가 안됨. 저도 처음엔 그랬는데 이거 터미널 적응하는거랑 키세팅도 빡셉니다. 깔자마자 한글 입력 안돼서 그거 셋업해야되고 저는 놋북 무선랜 드라이버도 따로 넣어줘야되고 개귀찮음 진짜. 그리고 어지간한 개발툴은 윈도 맥 리눅스 지원하니까 편한거 쓰면 됩니다. 개발하시는 분들이 맥이나 리눅스 많이 쓰긴 하지만, 그냥 많이 쓴다고 무작정 그거 쓰는것보단 자기 편한거 쓰는 게 짱입니다. 디코도 지원하는 리눅스를 지원 안 하는 카톡은 뭘까 사랑해요 디코 

 

Q14. Notion 좋아요?

A14. 전직장 개발자님이 전파한건데 이거 ㄹㅇ 와 진짜 개편합니다. 달력 생성도 돼서 스케줄러에 메모장으로도 쓰고 있어요. 실행도 빠릿빠릿하고 (인터넷 연결은 필요하지만) 싱크도 빠르고... 패드에서 그림 올리면 PC에 금방 뜨고, 그림을 옮기거나 글을 쓰면 그것도 빠릿빠릿하게 나타나고... 리눅스에서는 설치형은 없고 웹노션이 있습니다. 노션도 지원하는 웹을 지원 안하는 카톡은 뭘까 

 

Q15. 워드프레스에는 따로 연재 안하시나요?

A15. 거기는 이미지도 HTML로 올려야돼서 귀차니즘이 배가됩니다. 간단한거(별찍기)는 이미지 많이 안 올려도 돼서 워드프레스에 올리지만... 

 

Q16. 책 추천해주세요!

A16. Biopython 책 산 건 있는데 한 번 보고 안읽은듯... 

Q17. 이거 재밌나요?

A17. 저는 재밌습니다. Wordcloud도 재밌었고... 근데 균 학명에 미역김치는 진짜 어디서 나온걸까... 정답: 미역김치 

Q18. 코드는 따로 올려두는 공간이 있나요? 여기에는 py파일이 없는 거 같은데...

A18. 깃헙에 올려두고 있습니다. 그거 덕분에 파이썬이 매트랩 분량 이겼음.