제한효소 커터 2편 나왔음

사실 전에 만든 코드 이름은 Finder고, 이놈이 커터임. 

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import pandas as pd

이 코드도 판다스가 있어야된다. (DB가 csv)

enzyme_table = pd.read_csv('/home/koreanraichu/restriction.csv')
enzyme_table = enzyme_table.sort_values('Enzyme')
# Finder에도 쓰이는 '그' DB 맞습니다. 현재 수동 구축 중... 
print(enzyme_table)
print(len(enzyme_table))

아직도 갈 길이 멀지만 일단 D까지 추가했음... 아울러 py파일은 print가 빠집니다. 

 

sequence = input("검색할 시퀀스를 입력해주세요: ")

이건 시퀀스 입력받는 코드(아직 이름은 안 받음)

 

for i in range(len(enzyme_table)):
    res_find = enzyme_table['sequence'][i]
    res_find = str(res_find)
    if res_find in sequence:
        print(enzyme_table['Enzyme'][i],res_find,sequence.find(res_find))
    else: 
        print(enzyme_table['Enzyme'][i],"Not found")

문자열화가 for문 안에서 이루어지고, 자르는 효소와 자르지 않는 효소의 출력 방식만 다르다. 현재 저장도 지원 안 해줌.