cutter, finder, searcher에 앞으로 추가할 기능

FASTA 파일 지원

1) 일단 사용자가 FASTA파일을 읽어오게 되면 따로 시퀀스 정보 입력을 받을 필요가 없어서 그거 관련도니 처리가 필요함. (시퀀스 이름은 Biopython SeqIO로 FASTA파일 ID 가져올 예정)

2) Biopython의 경우 FASTA파일에 꺾쇠가 하나면 read, 여러개면 parse로 가져오는데 parse로 읽을 걸 read로 가져오면 에러뜸. 에러에 대한 처리가 필요하고... parse로 가져오는 파일은 꺾쇠가 여러개인데, 이게 다르게 말하면 ID랑 시퀀스라 여러개라 그거 읽어오면 여러개를 돌리고 저장까지 해야 하는거라 이거는 Jupyter단에서는 힘듭니다... OTL 그래서 단식만 읽을거임... 

3) FASTA 관련된 기능이긴 한데, 본인은 애초에 경로가 고정되어 있으니까 상관 없는데... 그리고 파일이 저장되는 위치가 Jupyter 코드가 있는 경로기도 하고(홈), 리눅스는 경로가 간단간단해요 생각보다... usr 이런거 아니면. 그래서 경로가 고정되어 있지만, 사용자들 입장에서 이러면 상당히 불편하기때문에... FASTA 파일 열 때 뿐 아니라 파일 저장할 때 저장 경로를 선택할 수 있는 창을 띄울 예정입니다... 아니 누가 자기 파일 경로를 다 외워... 

 

Searcher 기능 관련

1) Wildcard 기능(시퀀스 혹은 효소 이름)

2) restriction site에 N이나 W같은 알파벳이 있을 때 처리법... 이건 finder보다 cutter단에서 처리하는 게 쉽습니다. finder는 찾아서 텍스트를 대체해야 하니... 이거는 둘 다 정규식 찾아서 직접 해 보고 적응해야 합니다. N은 차라리 wildcard니까 적용하기 쉽지... W M 이런거는 or이라;;;; 

사실 언제 추가될지는 모르겠지만 일단 우선적으로 해보겠음.